微生物菌种保藏是确保菌种长期稳定性和活性的关键步骤。保藏方法的选择取决于菌种的特性和保藏目的。常用的保藏方法包括短期保藏法（如冰箱保藏和琼脂斜面培养）和中长期保藏法（如冻干保藏和液氮冷冻）。此外，还有特殊保藏方法，如玻璃化保藏，适用于特定菌种的长期保藏。

1）短期保藏法

冰箱保藏：将菌种保存在4°C的冰箱中，适用于短期保藏。

琼脂斜面培养：将菌种接种在琼脂斜面上，保存在冰箱中，适合数月至一年的保藏。此方法适用于细菌、酵母菌、霉菌等，但由于可能导致菌种活力逐渐下降，需要定期转接更新。

2）中长期保藏法

冻干保藏：通过冻干技术（在预冷和真空条件下，将微生物与保护剂混合后快速冷冻，接着通过升华去除水分，是微生物进入休眠状态。）将菌种脱水后保存，可以实现长期保藏。

液氮冷冻：将菌种悬浮于含保护剂的溶液中，然后迅速投入液氮或液氮蒸汽中保藏。 

3)特殊保藏方法

玻璃化保藏：通过快速冷冻形成玻璃态，防止冰晶形成损伤细胞，适合特殊菌种的长期保藏。 

4)保藏过程中的注意事项

确保菌种的纯度，避免污染。

详细记录菌种的名称、来源、接种日期等信息，便于管理和追溯。

定期检测菌种的活性和纯度，确保菌种的稳定性。